一直处于低配置水平的交通运输行业，特别是航空股遭遇基金大幅减持，南方航空和中国国航被减仓超过60%。
2008年一季度基金持有交通运输股票市值占基金持股总市值的比重有所下降，由去年四季度的7.16%下降至6.05%。交运行业整体延续了去年全年的态势，仍处于低配水平。从交运各细分板块来看，除航运业基金持仓比重略有上升外，民航业、铁路运输和公路三个板块的基金持仓比重，都有不同程度的下降。其中，民航业、铁路运输和公路板块基金持仓比重分别从2007年四季度的2.65%、1.47%和0.04%下降至1.09%、1.32%和0.02%。
航空股更是遭受大幅减持，南方航空的基金重仓持股数，从2007年四季度的4亿股减仓至2008年一季度末的1.44亿股，减持幅度超过60%；国航亦被减持超过75%。但是，一季度基金对于航运业"宠爱有加"，持仓比例从1.73%提升至2.13%。民航业在油价持续高位运行下，航油价格上调趋势基本确立，短期航空股仍以关注风险为主；从长期看，兼具比较优势、行业资源整合优势、主业经营稳健的中国国航值得重点关注，而机场板块白云机场和上海机场可以配置。
值得关注的是，盐田港、深圳机场、怡亚通、飞马国际和山东高速五家上市公司，成为基金新进的重仓股；而在基金退出领域，日照港、福建高速、东方航空、赣粤高速、外运发展、中海海盛和广深铁路名列其中。